Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-11Q9UQG0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-11Q9UQG0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms