Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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