Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms