Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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