Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms