Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms