Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NLRP1Q9C000 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms