Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms