Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308.4 ms