Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms