Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms