Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC115Q96NT0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms