Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC42Q96M95 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC42Q96M95 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms