Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
GCC1Q96CN9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms