Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms