Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29Q8TEQ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms