Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM71DQ8N9W8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM71DQ8N9W8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM71DQ8N9W8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM71DQ8N9W8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM71DQ8N9W8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM71DQ8N9W8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms