Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP4Q8N3C7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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