Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms