Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUFY3Q7L099 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY3Q7L099 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms