Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XIRP1Q702N8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XIRP1Q702N8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms