Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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