Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms