Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPPQ6IPU0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPPQ6IPU0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms