Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD40Q6AI12 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40Q6AI12 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms