Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL6IP4Q66PJ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL6IP4Q66PJ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms