Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms