Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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