Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME3Q16798 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME3Q16798 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME3Q16798 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME3Q16798 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME3Q16798 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME3Q16798 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME3Q16798 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME3Q16798 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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