Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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