Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKD1Q15139 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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