Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HDM1Q15032 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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