Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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