Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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