Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFSWAPQ12872 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFSWAPQ12872 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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