Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
SME1Q12330 DOP1YDR141C 5097 nt0.61□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YLL007CYLL007C 1998 nt0.6□□□□□ -2.31
SME1Q12330 ATG31YDR022C 591 nt0.6□□□□□ -2.31
SME1Q12330 RPS20YHL015W 366 nt0.6□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.6□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YJR011CYJR011C 786 nt0.59□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YBR064WYBR064W 429 nt0.59□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.58□□□□□ -2.32
SME1Q12330 UTP10YJL109C 5310 nt0.58□□□□□ -2.32
SME1Q12330 PMP1YCR024C-A 123 nt0.57□□□□□ -2.32
SME1Q12330 NHP2YDL208W 471 nt0.57□□□□□ -2.32
SME1Q12330 ECM12YHR021W-A 456 nt0.57□□□□□ -2.32
SME1Q12330 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.57□□□□□ -2.32
SME1Q12330 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.57□□□□□ -2.32
SME1Q12330 PTP2YOR208W 2253 nt0.56□□□□□ -2.32
SME1Q12330 NOP9YJL010C 2001 nt0.56□□□□□ -2.32
SME1Q12330 YDR521WYDR521W 336 nt0.56□□□□□ -2.32
SME1Q12330 YBR206WYBR206W 324 nt0.56□□□□□ -2.32
SME1Q12330 NIP100YPL174C 2607 nt0.56□□□□□ -2.32
SME1Q12330 YCK3YER123W 1575 nt0.55□□□□□ -2.32
SME1Q12330 OLI1Q0130 231 nt0.55□□□□□ -2.32
SME1Q12330 YPL044CYPL044C 549 nt0.55□□□□□ -2.32
SME1Q12330 NPR2YEL062W 1848 nt0.54□□□□□ -2.32
SME1Q12330 RPL38YLR325C 237 nt0.54□□□□□ -2.32
SME1Q12330 YLR456WYLR456W 615 nt0.54□□□□□ -2.32
SME1Q12330 CMC4YMR194C-B 222 nt0.54□□□□□ -2.32
SME1Q12330 MCM10YIL150C 1716 nt0.54□□□□□ -2.32
SME1Q12330 CHS6YJL099W 2241 nt0.53□□□□□ -2.32
SME1Q12330 YDR426CYDR426C 378 nt0.53□□□□□ -2.32
SME1Q12330 YPL185WYPL185W 396 nt0.52□□□□□ -2.33
SME1Q12330 LTE1YAL024C 4308 nt0.52□□□□□ -2.33
SME1Q12330 YJL007CYJL007C 315 nt0.51□□□□□ -2.33
SME1Q12330 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.51□□□□□ -2.33
SME1Q12330 YLR434CYLR434C 384 nt0.51□□□□□ -2.33
SME1Q12330 PRP16YKR086W 3216 nt0.5□□□□□ -2.33
SME1Q12330 BSC3YLR465C 309 nt0.5□□□□□ -2.33
SME1Q12330 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.5□□□□□ -2.33
SME1Q12330 YML002WYML002W 2214 nt0.49□□□□□ -2.33
SME1Q12330 PCC1YKR095W-A 267 nt0.49□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 YKL063CYKL063C 504 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 YPL205CYPL205C 345 nt0.47□□□□□ -2.33
SME1Q12330 SPO21YOL091W 1830 nt0.46□□□□□ -2.34
SME1Q12330 YOR218CYOR218C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
SME1Q12330 PAA1YDR071C 576 nt0.45□□□□□ -2.34
SME1Q12330 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.45□□□□□ -2.34
SME1Q12330 RPL26BYGR034W 384 nt0.45□□□□□ -2.34
SME1Q12330 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.45□□□□□ -2.34
SME1Q12330 YPL068CYPL068C 882 nt0.45□□□□□ -2.34
SME1Q12330 PAM16YJL104W 450 nt0.44□□□□□ -2.34
SME1Q12330 YOR053WYOR053W 342 nt0.44□□□□□ -2.34
SME1Q12330 HMRA2YCR096C 360 nt0.43□□□□□ -2.34
SME1Q12330 VPS20YMR077C 666 nt0.43□□□□□ -2.34
SME1Q12330 YNL211CYNL211C 261 nt0.43□□□□□ -2.34
SME1Q12330 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.43□□□□□ -2.34
SME1Q12330 ASE1YOR058C 2658 nt0.42□□□□□ -2.34
SME1Q12330 FYV10YIL097W 1551 nt0.41□□□□□ -2.34
SME1Q12330 ANS1YHR126C 480 nt0.41□□□□□ -2.34
SME1Q12330 Q0017Q0017 162 nt0.41□□□□□ -2.34
SME1Q12330 CSN9YDR179C 489 nt0.4□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.4□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YLR202CYLR202C 327 nt0.4□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YLR334CYLR334C 381 nt0.4□□□□□ -2.35
SME1Q12330 SGF11YPL047W 300 nt0.39□□□□□ -2.35
SME1Q12330 PRM3YPL192C 402 nt0.39□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YBR285WYBR285W 435 nt0.38□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YAR029WYAR029W 225 nt0.37□□□□□ -2.35
SME1Q12330 RPS25BYLR333C 327 nt0.37□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YPL225WYPL225W 441 nt0.37□□□□□ -2.35
SME1Q12330 PET111YMR257C 2403 nt0.36□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YER079WYER079W 633 nt0.36□□□□□ -2.35
SME1Q12330 SBH1YER087C-B 249 nt0.36□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.36□□□□□ -2.35
SME1Q12330 TAR1YLR154W-C 375 nt0.36□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.36□□□□□ -2.35
SME1Q12330 OST1YJL002C 1431 nt0.36□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.35□□□□□ -2.35
SME1Q12330 COX5BYIL111W 456 nt0.35□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.35□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YJR157WYJR157W 363 nt0.35□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YNL324WYNL324W 396 nt0.35□□□□□ -2.35
SME1Q12330 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.35□□□□□ -2.35
SME1Q12330 SEC8YPR055W 3198 nt0.35□□□□□ -2.35
SME1Q12330 AGA2YGL032C 264 nt0.34□□□□□ -2.36
SME1Q12330 YJL120WYJL120W 324 nt0.34□□□□□ -2.36
SME1Q12330 YMR321CYMR321C 318 nt0.34□□□□□ -2.36
SME1Q12330 PAU12YGR294W 363 nt0.33□□□□□ -2.36
SME1Q12330 PRP5YBR237W 2550 nt0.32□□□□□ -2.36
SME1Q12330 YOR121CYOR121C 306 nt0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms