Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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