Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN5Q08AF3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms