Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE4DQ08499 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms