Protein–RNA interactions for Protein: Q08474

VAM10, Vacuolar morphogenesis protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM10Q08474 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.14□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 BEM3YPL115C 3387 nt0.14□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.13□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.13□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 BER1YLR412W 825 nt0.13□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 RPB10YOR210W 213 nt0.13□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YPL261CYPL261C 309 nt0.13□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 Q0255Q0255 1419 nt0.13□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 PET111YMR257C 2403 nt0.12□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 snR72snR72 98 nt0.12□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YDR029WYDR029W 315 nt0.12□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 RPS27AYKL156W 249 nt0.12□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YMR321CYMR321C 318 nt0.12□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YPL044CYPL044C 549 nt0.12□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 SVS1YPL163C 783 nt0.12□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 SNU56YDR240C 1479 nt0.11□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 NFU1YKL040C 771 nt0.11□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YBR206WYBR206W 324 nt0.11□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.1□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YKL202WYKL202W 582 nt0.1□□□□□ -2.39
VAM10Q08474 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.09□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 EMC4YGL231C 573 nt0.09□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.09□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YPL182CYPL182C 384 nt0.09□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 INP2YMR163C 2118 nt0.08□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.08□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.08□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YPL185WYPL185W 396 nt0.08□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 TSC3YBR058C-A 243 nt0.08□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 VIK1YPL253C 1944 nt0.08□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.08□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 PRP5YBR237W 2550 nt0.07□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 OLI1Q0130 231 nt0.07□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 MLP1YKR095W 5628 nt0.07□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 HAL9YOL089C 3093 nt0.07□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 NIP100YPL174C 2607 nt0.06□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 CUL3YGR003W 2235 nt0.06□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YJR011CYJR011C 786 nt0.06□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 MYO1YHR023W 5787 nt0.06□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.05□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 TIM13YGR181W 318 nt0.05□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 RPS20YHL015W 366 nt0.05□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 snR51snR51 107 nt0.05□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 RCO1YMR075W 2055 nt0.04□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YCR001WYCR001W 315 nt0.04□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 OST4YDL232W 111 nt0.04□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YAP6YDR259C 1152 nt0.04□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YIR044CYIR044C 186 nt0.04□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.04□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 SDH7YDR511W 402 nt0.03□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.03□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 PBI2YNL015W 228 nt0.03□□□□□ -2.4
VAM10Q08474 BUL2YML111W 2763 nt0.02□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 COX12YLR038C 252 nt0.02□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YML108WYML108W 318 nt0.02□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 ORC3YLL004W 1851 nt0.01□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YDL011CYDL011C 324 nt0.01□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 MAM33YIL070C 801 nt0.01□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 COX5BYIL111W 456 nt0.01□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 MLP2YIL149C 5040 nt0.01□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 PAA1YDR071C 576 nt0□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YLR269CYLR269C 351 nt0□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YOR345CYOR345C 351 nt0□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 PRP42YDR235W 1635 nt-0.01□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.01□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.01□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 SPO21YOL091W 1830 nt-0.01□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 RPF1YHR088W 888 nt-0.02□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YBL071CYBL071C 309 nt-0.02□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YNL211CYNL211C 261 nt-0.02□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YOR053WYOR053W 342 nt-0.02□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 PTP2YOR208W 2253 nt-0.03□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YFL012WYFL012W 447 nt-0.03□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 RPS26AYGL189C 360 nt-0.03□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 YHL041WYHL041W 450 nt-0.03□□□□□ -2.41
VAM10Q08474 ATG31YDR022C 591 nt-0.04□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 GPI15YNL038W 690 nt-0.04□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.04□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 LEE1YPL054W 906 nt-0.04□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 snR45snR45 172 nt-0.04□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.05□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 YLR171WYLR171W 390 nt-0.05□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 snR190snR190 190 nt-0.05□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 YER084W-AYER084W-A 513 nt-0.06□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.06□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.07□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 COY1YKL179C 2040 nt-0.08□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 ULI1YFR026C 510 nt-0.08□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.08□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 YNL058CYNL058C 951 nt-0.08□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 YNL146WYNL146W 303 nt-0.08□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 ZEO1YOL109W 342 nt-0.08□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 SOV1YMR066W 2697 nt-0.09□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 YPL229WYPL229W 621 nt-0.09□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 COG8YML071C 1824 nt-0.09□□□□□ -2.42
VAM10Q08474 SSS1YDR086C 243 nt-0.1□□□□□ -2.43
VAM10Q08474 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.1□□□□□ -2.43
VAM10Q08474 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.11□□□□□ -2.43
VAM10Q08474 MRPL50YNR022C 420 nt-0.11□□□□□ -2.43
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