Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TGM3Q08188 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms