Protein–RNA interactions for Protein: Q06541

ARV1, Protein ARV1, yeastyeast

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARV1Q06541 SWF1YDR126W 1011 nt0.66□□□□□ -2.3
ARV1Q06541 YDR521WYDR521W 336 nt0.66□□□□□ -2.3
ARV1Q06541 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.66□□□□□ -2.3
ARV1Q06541 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.66□□□□□ -2.3
ARV1Q06541 RPL26AYLR344W 384 nt0.66□□□□□ -2.3
ARV1Q06541 CMC4YMR194C-B 222 nt0.66□□□□□ -2.3
ARV1Q06541 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
ARV1Q06541 YLL007CYLL007C 1998 nt0.66□□□□□ -2.3
ARV1Q06541 ISF1YMR081C 1017 nt0.65□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 LTE1YAL024C 4308 nt0.65□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 ATG31YDR022C 591 nt0.64□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 RPS24BYIL069C 408 nt0.64□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 MAM33YIL070C 801 nt0.64□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 RPS20YHL015W 366 nt0.63□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YKL063CYKL063C 504 nt0.63□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.63□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YJL007CYJL007C 315 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 RPL38YLR325C 237 nt0.62□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.61□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YML002WYML002W 2214 nt0.6□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 INA22YIR024C 651 nt0.6□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.6□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YOR029WYOR029W 336 nt0.6□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 PMP1YCR024C-A 123 nt0.59□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 STF2YGR008C 255 nt0.59□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 ECM12YHR021W-A 456 nt0.59□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YLR456WYLR456W 615 nt0.59□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YPL044CYPL044C 549 nt0.59□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 YPL185WYPL185W 396 nt0.59□□□□□ -2.31
ARV1Q06541 BFR2YDR299W 1605 nt0.58□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 YJR011CYJR011C 786 nt0.57□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 HUG1YML058W-A 207 nt0.57□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.57□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 RPS30BYOR182C 192 nt0.57□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 NIP100YPL174C 2607 nt0.56□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 NOP9YJL010C 2001 nt0.56□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 YDR344CYDR344C 444 nt0.56□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 YDR426CYDR426C 378 nt0.56□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 OLI1Q0130 231 nt0.56□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 PCC1YKR095W-A 267 nt0.56□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.56□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 NPR2YEL062W 1848 nt0.56□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 OST1YJL002C 1431 nt0.55□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 SPO21YOL091W 1830 nt0.55□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 YPL205CYPL205C 345 nt0.55□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 PAA1YDR071C 576 nt0.54□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 YBR064WYBR064W 429 nt0.54□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 YCK3YER123W 1575 nt0.53□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 YBR206WYBR206W 324 nt0.53□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 Q0017Q0017 162 nt0.53□□□□□ -2.32
ARV1Q06541 HMRA2YCR096C 360 nt0.52□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 YOR218CYOR218C 420 nt0.52□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 YLR202CYLR202C 327 nt0.51□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 YSP1YHR155W 3687 nt0.51□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 CHS6YJL099W 2241 nt0.5□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 RPL26BYGR034W 384 nt0.5□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 YLR434CYLR434C 384 nt0.5□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 BSC3YLR465C 309 nt0.5□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 YMR160WYMR160W 2451 nt0.5□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 IQG1YPL242C 4488 nt0.5□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 MCM10YIL150C 1716 nt0.49□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 VPS20YMR077C 666 nt0.48□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 YNL324WYNL324W 396 nt0.48□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 YOR053WYOR053W 342 nt0.48□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 YPL068CYPL068C 882 nt0.47□□□□□ -2.33
ARV1Q06541 MLP2YIL149C 5040 nt0.46□□□□□ -2.34
ARV1Q06541 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.45□□□□□ -2.34
ARV1Q06541 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.44□□□□□ -2.34
ARV1Q06541 SEC8YPR055W 3198 nt0.43□□□□□ -2.34
ARV1Q06541 BEM3YPL115C 3387 nt0.42□□□□□ -2.34
ARV1Q06541 FYV10YIL097W 1551 nt0.41□□□□□ -2.34
ARV1Q06541 FMP27YLR454W 7887 nt0.41□□□□□ -2.34
ARV1Q06541 YLR334CYLR334C 381 nt0.41□□□□□ -2.34
ARV1Q06541 YBR285WYBR285W 435 nt0.41□□□□□ -2.34
ARV1Q06541 AGA2YGL032C 264 nt0.4□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.4□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 YNL211CYNL211C 261 nt0.4□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.4□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 PRM3YPL192C 402 nt0.4□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 PET111YMR257C 2403 nt0.4□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 UTP20YBL004W 7482 nt0.4□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 MLP1YKR095W 5628 nt0.4□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.39□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.39□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.39□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.39□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.39□□□□□ -2.35
ARV1Q06541 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.6 ms