Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSME1Q06323 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms