Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN1Q05586 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms