Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 snR51snR51 107 nt0.29□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YDL011CYDL011C 324 nt0.28□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 SBH1YER087C-B 249 nt0.28□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.28□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YJR011CYJR011C 786 nt0.28□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 PBI2YNL015W 228 nt0.28□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YBL071CYBL071C 309 nt0.28□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 ESP1YGR098C 4893 nt0.28□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 SDH7YDR511W 402 nt0.27□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.27□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 AIM29YKR074W 468 nt0.27□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 BSC3YLR465C 309 nt0.27□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 NIP100YPL174C 2607 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 YHL041WYHL041W 450 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 RPS27AYKL156W 249 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 YML108WYML108W 318 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 ZEO1YOL109W 342 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 YPL044CYPL044C 549 nt0.26□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 FYV10YIL097W 1551 nt0.25□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 YOR029WYOR029W 336 nt0.25□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 OLI1Q0130 231 nt0.23□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 PAU12YGR294W 363 nt0.23□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 RPS20YHL015W 366 nt0.23□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 EAF6YJR082C 342 nt0.23□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 MAM33YIL070C 801 nt0.22□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.22□□□□□ -2.37
YMR226CQ05016 UTP20YBL004W 7482 nt0.21□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YIR044CYIR044C 186 nt0.21□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 INP2YMR163C 2118 nt0.21□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 RPS30BYOR182C 192 nt0.21□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 BEM3YPL115C 3387 nt0.21□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.21□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 CBS1YDL069C 690 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YAP6YDR259C 1152 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YHR125WYHR125W 306 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YLR287CYLR287C 1068 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YNR025CYNR025C 360 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YPL185WYPL185W 396 nt0.2□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 ULP2YIL031W 3105 nt0.19□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 ATG31YDR022C 591 nt0.19□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 PET111YMR257C 2403 nt0.19□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 PRP5YBR237W 2550 nt0.19□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 CUL3YGR003W 2235 nt0.18□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 BI2Q0110 1272 nt0.18□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 FYV7YLR068W 456 nt0.17□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YPL229WYPL229W 621 nt0.17□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 DIE2YGR227W 1578 nt0.16□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 ISF1YMR081C 1017 nt0.16□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YNL211CYNL211C 261 nt0.16□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.16□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.16□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.15□□□□□ -2.38
YMR226CQ05016 VIK1YPL253C 1944 nt0.15□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YKL083WYKL083W 615 nt0.15□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 HAL9YOL089C 3093 nt0.15□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 SEC8YPR055W 3198 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 MLP1YKR095W 5628 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 OST4YDL232W 111 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YGR290WYGR290W 444 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YLR171WYLR171W 390 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YNL058CYNL058C 951 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YNL122CYNL122C 348 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 MRPL50YNR022C 420 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 STE5YDR103W 2754 nt0.14□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YHR130CYHR130C 336 nt0.13□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YOR345CYOR345C 351 nt0.13□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.13□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 snR54snR54 86 nt0.13□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 BIR1YJR089W 2865 nt0.13□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.13□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 AI1Q0050 2505 nt0.13□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 TRS65YGR166W 1683 nt0.12□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.12□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YDR426CYDR426C 378 nt0.12□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YLR101CYLR101C 396 nt0.12□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 TOM22YNL131W 459 nt0.12□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 PCF11YDR228C 1881 nt0.12□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 MLP2YIL149C 5040 nt0.11□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 IQG1YPL242C 4488 nt0.11□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 PTP2YOR208W 2253 nt0.11□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 COX5BYIL111W 456 nt0.11□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 ORC3YLL004W 1851 nt0.11□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 RCO1YMR075W 2055 nt0.1□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 PRP42YDR235W 1635 nt0.1□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.1□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 TAR1YLR154W-C 375 nt0.1□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YAR047CYAR047C 321 nt0.1□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YLR334CYLR334C 381 nt0.1□□□□□ -2.39
YMR226CQ05016 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.09□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.09□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YMR321CYMR321C 318 nt0.09□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 SPO21YOL091W 1830 nt0.08□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 PAA1YDR071C 576 nt0.08□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.08□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.08□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 YPL225WYPL225W 441 nt0.08□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 STF2YGR008C 255 nt0.07□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.07□□□□□ -2.4
YMR226CQ05016 ECL1YGR146C 636 nt0.07□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms