Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms