Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OC90Q02509 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OC90Q02509 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OC90Q02509 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OC90Q02509 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms