Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms