Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX3P78415 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX3P78415 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX3P78415 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX3P78415 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX3P78415 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms