Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms